파이프라인 · 재현성

수집한 데이터를 재현 가능한 워크플로로 처리하는 단계입니다. 같은 입력이면 누구나 같은 결과를 얻도록 자동화·컨테이너화합니다.

모델 학습과 서빙까지 이어지는 경계는 데이터와 학습 파이프라인에서 정리합니다.

주제

• 워크플로 엔진 — Nextflow, nf-core
• 컨테이너 — Docker / Podman, Singularity
• 인프라 — Kubernetes, Linux 환경, 클라우드(AWS/GCP/Azure)

정리 예정 / 진행 중

• Nextflow DSL2 모듈 작성 패턴
• nf-core 파이프라인 커스터마이징(ampliseq, taxprofiler)
• Docker/Podman 이미지 빌드 · Singularity 변환
• HPC / Kubernetes 실행 프로파일